El inmueble fue construido en 1900 como regalo a Don Olegario molina Solís, por motivo del matrimonio de su hija Carmela Molina, motivo por el cual el inmueble es conocido como casa Molina, su construcción estuvo a cargo del ingeniero Manuel Cantón Ramos, Quien también dirigió la construcción de las casas gemelas que se ubica el paseo de Montejo.
En 1924 el señor Manuel Zapata Martínez compró la casa como regalo de bodas a su hija, Quien la ha visto hasta su muerte alrededor de la década de los setentas fecha en la que fue adquirida por el gobierno del estado Y pasó a fungir como museo del Pueblo Maya del Instituto Nacional indigenista hasta 1995 año en que cerró su puertas.
En 2017 la casa Molina fue adquirida por el fomento cultural Banamex inicia su labor de museo de arte popular con la finalidad de fortalecer y preservar el patrimonio intangible de México que es la artesanía, En este museo se pueden apreciar distintas piezas representativas de varios estados del país, Destacan la artesanía de Yucatán, Oaxaca, Guerrero y Michoacán. Entre las piezas se pueden encontrar bellas piezas de barro, Papel maché, Madera y metal, Prendas de vestir trajes típicos de gran calidad, instrumentos musicales, muebles y máscaras entre otros objetos autóctonos.